Peran serta kalangan pesantren hari ini sangat penting dalam menangkal Penyebaran Faham Radikalisme Islam dengan menggunakan berbagai sarana dan media untuk mencegah perluasan faham mereka, diantaranya melalui :
1. Pengkaderan pembinaan santri maupun sosialisasi kepada masyarakat luas.
2. Mengambil alih kembali masjid-masjid yang kurang “diurus” oleh masyarakat sekitar sehingga berhasil “dikuasai” Kelompok Islam radikal .
3. Melalui penerbitan majalah, buletin, dan booklet, termasuk internet untuk Memberikan penjelasan tentang Islam secara memadai. Misi ajaran Islam yang sebenarnya sangat mulia dan luhur seringkali justru mengalami distorsi akibat pemahaman yang keliru terhadap beberapa aspek ajaran Islam yang berpotensi menimbulkan faham radikalisme.