Pada umumnya Kabupaten Lingga beriklim basah dengan curah hujan pertahun rata-rata sekitar 2.214 mm dengan jumlah hari hujan sebanyak 110. Temperatur terendah 22°c dan tertinggi 32°c dengan kelembaban udara 85%. Kondisi perairan di sekitar wilayah Kabupaten Lingga umumnya mempunyai kedalaman yang relatif dangkal yaitu sekitar 40 m dengan dasar lumpur berpasir dan berkarang.